miRNA在基因的翻译阶段发挥作用，miRNA来源于特定的基因卒，siRNA则是来源于mRNA，转座子，病毒或异染色质DNA。
miRNA是由更长的前体发卡转录本（longer precursor hairpin transcripts ）剪切形成，这一过程由RNase III核酸内切酶实现，而siRNA则是由长的RNA二聚体加工而成的。
每个miRNA发卡前休（hairpin precursor）产生一个miRNA二聚体，而每个siRNA前体分子产生多个siRNA二聚体。
siRNA的序列极少是保守的，而miRNA的序列则表现出明显的保守特征。
siRNA的所有碱基都参与其靶基因的特异性，而miRNA只有5‘端的种子区参与其靶基因的特异性。
miRNA通常与靶基因转录本的3’UTR端结合，而siRNA则与靶基因的mRNA的任何位置结合。
miRNA对靶基因的抑制作用称为hetero- silencing，而siRNA的这种作用称为auto silencing。
miRNA作为一种信号分子对翻译进行中止，而siRNA对翻译则是一种物理中止。miRNA与siRNA都能发挥RNA干扰作用(RNAi)，在对基因的调控上，miRNA的作用要弱，它是一种天然的分子，是一种内源性的作用，而siRNA的作用很强，通常作为分子工具，对特定的基因进行沉默，siRNA是内源的或者是人工合成的，但这二者最终都是通过RISC来对mRNA进行降解。
miRNA在发挥作用的时候，通常是以单链的形式来发挥作用的，而siRNA则通常是以双链的形式来发挥作用。
参考资料